בעת הדיון להפקדה, מוסד התכנון ידון בתכנית ובמסמכים בנושא זיהום קרקע/גז קרקע/ מי תהום, ויבחן, בין היתר, את השפעת ממצאי המסמכים על ההיבטים הבאים: פריסת והיקף ייעודי הקרקע, הצורך להקצות שטח זמני או קבוע לתשתיות טיפול בזיהום הקרקע או המים, הצורך להגביל את עומקי הפיתוח, והצורך לקבוע הוראות שלביות והוראות נוספות, ככל שנדרשות כתנאים להכנת תכניות מפורטות (כשמדובר בתכנית כוללנית/מתארית) וכתנאים לקבלת היתרי בניה.