בנוסף לרוב העלויות המוזכרות לעיל, שהן מוחשיות (כלומר, ניתנות למדידה בכסף), יש גם עלויות לא מוחשיות, שאינן ניתנות למדידה בכסף. כאלה הם עלויות והפסדים הנובעים מתופעות שיש להן השפעות שליליות כגון רעש, חוסר נוחות, סיכון ועוד. עלויות לא מוחשיות אחדות ניתנות למדידה בכסף בעקיפין, באמצעות ההשקעות הראשוניות ו/או ההוצאות השוטפות הנדרשות כדי לבטל או לצמצם את ההשפעות השליליות (בידוד אקוסטי, מערכות בטיחות מיוחדות, שמירה ופיקוח, ניהול אחזקה ועוד). אבל יש גם עלויות לא מוחשיות שלא ניתנות למדידה בכסף (חוסר נוחות, סביבה מעיקה וכד'). אף שלא כל העלויות הלא מוחשיות ניתנות למדידה ולכימות, יש להביאן בחשבון בבחירת החלופה העדיפה.
תחולה: בקשות להיתר בכל מרחבי התכנון בארץ, בבחינת הצורך בבניית מוסדות חינוך אנכיים — בחירת החלופה העדיפה.