מערכת אויר רפואי למכשור תשמש בלעדית לאספקת אויר המיועד להפעלת ציוד ומכשור רפואי שאינו קשור במישרין להנשמת בני אדם. האויר המסופק מהמערכת ישמש לדוגמה להפעלת כלי ניתוח, להפעלת יחידות אספקה מתכווננות (בומים) ולהפעלת מחוללי ואקום (ונטורי) במערכות פינוי גזי הרדמה.